1、水污染控制技术研究所

2、水污染控制工程研究所

3、大气污染控制技术研究所

4、环境管理研究所

5、环境治理综合技术研究所

6、国家城市环境污染控制工程技术研究中心

7、国家环境保护工业废水污染控制工程技术（北京）中心

8、北京水环境技术与设备研究中心

9、北京市环科环境工程设计所

10、环境系统分析研究所（原环境模拟与信息中心）