这种情况一般只影响下一代，对第三代没有影响。

表兄妹结婚很容易导致基因链条出现异常，使下一代出现畸形的可能性增大，但是不会影响到第三代。在备孕期间用到叶酸，可以起到一定的预防作用。

近亲结婚很容易导致染色体基因突变，使孩子本身有遗传疾病，不利于下一代的健康。但不会百分百存在遗传问题，只是容易导致下一代遗传病发病率增高。