1、以整套房屋作为设计单元的系统设计，而窗机的是以房间作为设计单元的。

　　2、管道系统的度身定制更加有利于房屋的气流组织，新风换气效果好。而窗机在小面积房间的应用有一定作用，房间面积不能大，否则不利于形成气流组织。

　　3、噪音：窗机在房间内，有噪音的隐患。而管道系统主机一般设置在房间之外的区域，无噪音。

　　4、舒适度：窗机很少有全热交换，即使有，受主机功率低（噪音控制）静压低、转速低以及全热交换芯体小和接触截面积小，和空气过滤效果形同虚设等缘故。导致热回收效果以及空气净化微乎其微。直接的后果就是户外的空气会没经过净化的送到室内，而且会破坏室内的舒适温度和增加空调地暖的能耗。

　　5、毕竟窗机在日本也多应用于小型单身公寓，在国内很难成为主流。