启东的房价高于南通的原因主要有以下几点：

1. 地理位置优越

启东地理位置优越，紧邻长江三角洲经济圈的核心区域，与上海等一线城市距离较近，这使得启东成为投资和居住的热土。随着长三角一体化进程的加快，启东的房价受到周边城市需求的带动，呈现出上涨趋势。

2. 经济发展带动

启东的经济发展势头强劲，尤其在制造业、服务业等领域表现突出。随着企业的发展和人口的聚集，对住房的需求也在不断增加。这种供需关系推动了房价的上涨。

3. 教育资源丰富

启东拥有较为完善的教育资源，包括一些知名学校和优质的教育机构。这使得许多家庭为了子女的教育而选择在启东购房，进一步推动了启东房价的上涨。

4. 旅游资源推动

启东拥有丰富的旅游资源，如迷人的海滩、历史文化景点等，这些都吸引了大量的游客和投资者。旅游业的发展带动了当地经济的增长，也推动了房价的上涨。

综上所述，启东的房价高于南通，主要得益于其优越的地理位置、强劲的经济发展、丰富的教育资源和旅游资源的推动。这些因素共同作用，使得启东成为了一个热门的投资和居住城市，从而带动了房价的上涨。