佣金的计算方法主要分为两种：一是基于成交额的固定比例，如股票交易的佣金率通常为成交额的0.02%，即万分之2，属于较低的费率。此外，印花税按成交额的1%计算，过户费则是沪市股票的万分之0.02，这些费用都是在交易成本中的一部分。

二是根据双方约定的明佣和暗佣方式。明佣是交易双方直接约定在交易总价中抽取一定比例，例如2%的佣金，交易结束后按实际金额计算。暗佣则是总价中已包含佣金，如交易总价100万美元，其中98万美元为货款，2万美元为佣金。

佣金的支付需要符合法律规定，必须有合法真实的凭证，并且支付给独立的中介服务提供者，个人佣金不得超过服务金额的5%。企业支付的佣金需要符合税务规定，不能抵减销售业务的收入，而是计入销售费用并在所得税前扣除。因此，佣金的计算不仅考虑交易金额，还要遵守相应的法规要求。