这两个词语是近义词。意思相近，但各有侧重。

首先语意不同。巧妙，落在巧字意思上，灵活的处理问题。奥妙的奥字，是内在的规律的意思。

而且，词义范围不同。巧妙一般用在生活的小事中，奥妙用于真理啊，规律啊的大一点的事儿上。