蛇口港的港口业务涵盖了广泛的货物类型，主要分为散杂货业务和集装箱业务。

在散杂货业务方面，蛇口港致力于处理各类大宗散装货物的装卸，包括粮食、化肥、废钢、矿石、饲料和水泥等。此外，还负责钢材、木材、石料、机电设备以及各类件杂货的装卸。特别值得一提的是，港口还提供散装化肥、粮食和饲料的灌包服务，以及处理特殊重大件货物的装卸。进口卷钢运输也是其服务的一部分。

在集装箱业务上，蛇口港提供高效的服务，包括装卸、堆存、拼箱和拆箱操作。港务设施还包括陆路拖运服务，并协助口岸单位进行集装箱查验。对于外贸业务，蛇口港开通了蛇口至香港的天天班轮，保证货物的及时收发，并提供香港中流作业，与MAERSK、K'LINE、PIL、COSCO、CNC、KANWAY、CCNI、DELMAS等多家知名船公司紧密合作，实行全程报关报检的"一条龙"服务。

对于内贸集装箱业务，蛇口港开通了覆盖全国沿海及内河流域近30个港口的航线，包括蛇口至上海、南京、青岛等地。提供航线咨询、订舱服务，并开展第三方物流服务，为内贸货物提供全程包干的"一条龙"服务。同时，码头拆装箱服务也是其服务的重要组成部分。