在工程审计过程中，审计费用的支付方式通常根据项目的不同而有所变化，一般由业主与审计单位协商决定，按结算造价的比例支付。比如，某项目结算造价为1000万元，双方约定的审计费用比例为2%，那么审计费用为20万元。若审计后发现实际造价为960万元，没有超出5%的部分，审计费用仍为20万元。但如果最终造价为800万元，审计后发现超出部分为160万元，按5%的比例，超出部分的审计费用为8万元，这部分费用将由施工单位承担。

具体来说，如果一个项目的结算造价为1000万元，审计费用比例为2%，那么审计单位可以获得20万元。若审核后的实际造价为960万元，实际造价比结算造价降低了4.17%，没有超出5%的范围，因此审计费用不变，仍为20万元。但如果审核后的实际造价为800万元，实际造价比结算造价降低了20%，超出部分为160万元，按照5%的比例，超出部分的审计费用为8万元，这8万元将由施工单位承担。因此，最终审计单位可以得到28万元。

值得注意的是，审计过程中不仅包括核减部分，还包括核增部分。核增部分也是需要计算审计费用的，这可能进一步增加施工单位的负担。

综上所述，施工方需要承担超出部分的审计费用，具体比例根据项目的具体情况而定，这需要在项目初期就明确约定。