仙人掌科包含多种多样的植物，其中一些最为人熟知的品种包括仙人掌、仙人球、量天尺、武伦柱、秘鲁苹果、龟甲牡丹、昙花、吹雪柱、大豪丸、火龙果、乌羽玉和蟹爪兰等。

在仙人掌科的分类系统中，叶仙人掌亚科（Pereskioideae）主要包括叶仙人掌属（木麒麟属，Pereskia Mill.）和拟叶仙人掌属（Maihuenia Phil.）等。

仙人掌亚科（Opuntioideae）则包括顶花麒麟掌属（Quiabentia Britton et Rose）、麒麟掌属（Pereskiopsis Britton et Rose）、翅子掌属（Pterocactus K. Schum.）、长蕊掌属（Tacinga Britton et Rose）、仙人掌属（Opuntia Tourn. ex Mill.）等。例如，岩牡丹属的龟甲牡丹、天轮柱属的秘鲁苹果（cereus repandus）和摩天柱属的武伦柱（Pachycereus pringlei）都属于这一亚科。

仙人柱亚科（Cereoideae）包含管花柱属的吹雪柱（Cleistocactus strausii）、仙人柱族（Cereeae）的仙人掌亚族（Cereinae）和量天尺亚族（Hylocereinae）等。量天尺属的火龙果（Hylocereus undatus）是该亚科中的一个经济价值较高的品种。

仙人球族（Cacteae）包括极光球亚族（Eriosycinae）、花座球亚族（Melocactinae）和金琥亚族（Echinocactinae）等。例如，花座球属的花座球（Melocactus Boehm.）、圆盘玉属的圆盘玉（Discocactus Pfeiff.）和金琥属的金琥（Echinocactus Link et Otto）都是这一族的成员。

仙人掌科的植物具有多种形态和特征，它们不仅美化了环境，还具有药用和食用价值。