日本一套别墅的价格约为人民币数百万至上千万不等。

日本别墅的价格因地区、地段、房屋大小、建筑年代及设施等因素而异。一般来说，像东京这样的大都市中心地段的别墅，价格往往较高。而在乡村或偏远地区，别墅的价格会相对更为亲民。

具体影响因素如下：

1. 地理位置：日本的不同地区经济发展程度有所不同，像东京、大阪、名古屋等大城市中心的别墅，由于地段优势，价格通常较高。而一些乡村或远离大城市的地区，别墅价格则相对便宜。

2. 房屋条件：别墅的新旧程度、大小、内部结构以及附属设施等都会影响其价格。新建的别墅、面积大且设计好的房子，价格自然更高。

3. 市场供需关系：与其他市场一样，房地产市场的供需关系也会影响价格。在某些热门地区，由于需求大于供应，别墅价格可能会上涨。

举例来说，一套位于东京郊区的中等条件别墅，其价格可能超过千万人民币。而在一些乡村地区，相同条件的别墅可能只需数百万元人民币。因此，要确定日本别墅的具体价格，还需考虑上述多种因素并结合当地的市场行情来判断。

如果您对某个具体地区的别墅价格感兴趣，建议与日本当地的房产机构或专业经纪人联系，获取更为详细和准确的信息。